Агент Фил Колсон (Кларк Грегг) и его коллеги из секретной организации Щ.И.Т. — бойцы невидимого фронта, которые стоят на защите мира и спокойствия жителей Земли. Многое изменилось после вторжения пришельцев в Нью-Йорк. Начали появляться новые супергерои, которые далеко не всегда выступают на стороне добра и справедливости. Кроме того, людям стали доступны новые технологии и даже артефакты внеземного происхождения, которые могут натворить немало бед, если попадут не в те руки. За всем этим следит таинственный Щ.И.Т. и если что-то выйдет из-под контроля, лучшие агенты организации найдут способ ликвидировать угрозу.
Уже год Мак выполняет обязанности директора «Щ.И.Т.а», из-за чего он расстаётся с Еленой, которая обретает новую любовь в лице агента Келлера. Тем временем, на другом конце Галактики агенты Дейзи Джонсон, Джемма Симмонс, Пайпер и Дэвис ищут Лео Фитца, который пробуди ...
Мак и Мэй нанимают нового учёного Маркуса Бенсона, который начинает изучение трупа х, застрявшего в стене. Группа Сержанта совершает ограбление ювелирного магазина для добычи кристаллов, нужных им для неизвестных целей. Мэй почти достигает Сержанта, однако он и е� ...
Фитц и Инок оказываются брошены на планете Китсон в результате череды событий. Дейзи и Джемма следуют за ними. Дэвис ловит Малахи, охотника члена группы хроникомов, желающих устранить Фитца. Фитц и Инок пытаются выиграть денег в инопланетном казино, но Инок проигр� ...
Сержант прибывает за Диком Шоу, который за год успел создать свою технологическую компанию. «Щ.И.Т.» отправляется спасать его. Мак и Дик ловят Джако и Пакса, Мэй же одолевает Снежинку, однако Сержант похищает Мэй. В то же время на Маяке Йо-Йо, Келлер и Бенсон проводил� ...
Корабль Конфедерации захватывает Зефир-1 с Дейзи, Джеммой, Дэвисом, Пайпер и Иноком на борту. Корабль принадлежит не Конфедерации, а группе хроникомов, ведомых Альтарой, бывшей главнокомандующей Инока, которая хочет использовать Лео Фитца, чтобы тот нашёл способ п� ...
Альтара помещает Фитца и Симмонс в тюрьму их объединенного разума, с целью воссоздания машины времени. Там Фитц узнаёт обо всех произошедших за время его отсутствия событиях. Ситуация осложняется тем, что их преследуют Доктор (версия Фитца из Фреймворка) и озлобле ...
Мак пытается понять, кто такой Сержант. «Щ.И.Т.» выслеживает носителей Сорокопутов. К всеобщему удивлению при непосредственной близости два носителя тела носителей начинают кристаллизоваться. Сержант подсказывает, что паразиты боятся холодных температур, и это п ...
Дейзи, Мэй, Сержант, Дик и Снежинка отправляются к месту, куда собираются все сорокопуты. Мак втайне следует за ними на Зефире. Паразиты образуют гигантскую кристаллическую структуру, продолжающую разрастаться. Сержант поясняет, что её необходимо уничтожить до пр� ...
До столкновения остаётся 6 минут. Сержант телепортируется на Зефир и с помощью Пэкса и Джако захватывает контроль, требуя развернуть самолёт. Дик не может вовремя обезвредить бомбу и грузовик таранит Башню. Дейзи удаётся сдержать взрыв вибрацией, но теперь им прих ...
Сержант начинает регенерировать и становиться сильнее. Мэй заявляет, что не помнит, как убивала Сержанта, и команда понимает, что кто-то захватывает их тела одного за другим. Захватчику нужен директор, имеющий доступ ко всем файлам и кодам. Заставив Дэвиса разбитьс ...
Айзель хочет узнать местонахождение храма Монолитов у Маркуса Бенсона. Она использует контейнер и создаёт копию его покойного мужа Томаса, после чего Бенсон выдаёт координаты, не желая видеть его смерть вновь и вновь. Маку и Йо-Йо удаётся отправить Бенсона сообщи� ...
Захватив тело Флинта, Айзель воссоздаёт Монолиты, после чего ломает ногу Флинта. Подавленный тем фактом, что никто его не ценит, Дик использует свои изобретения, чтобы телепортироваться в храм и спасти Мака, Йо-Йо и Флинта. Пайпер эвакуирует Флинта. В Сержанте оконч ...
Фитц и Симмонс передают о смерти Мэй. Хроникомы во главе с Малахи захватывает Маяк, убивая множество агентов и Тревора Хана. Фитц догадывается, что они сделали это с помощью разумов Фитца и Симмонс, и собирается убить себя и Джемму, чтобы уничтожить Скелет и хронико ...