События происходят между 2 и 3 эпизодами. Здесь повествуется о начале падения Ордена Джедаев и переходе Анакина на Тёмную Сторону Силы. Здесь вы узнаете, как создаются световые мечи, увидите новых джедаев и ситхов, узнаете всё о таинственном Графе Дуку и как был похищен Канцлер Палпатин. Все секреты Анакина раскрываются в этих двух сезонах великой саги Звёздные Войны!
В разгар битвы за Ринго-Винду, солдат-клон Тап, подвергнувшись странному внушению, совершает убийство мастера-джедая Типлар. Республиканцы решают отправить солдата на Камино, для изучения причин его помешательства. Опасаясь раскрытия коварных замыслов, граф Дуку приказывает адмиралу Тренчу похитить клона. Атаковав корабль с Тапом, дроиды везут его к Дуку, но Энакин Скайуокер, Рекс и Файфс пресекли побег, и повезли Тапа на Камино. ...
Клон Тап проходит медицинское обследование в стерильных лабораториях Камино, чтобы найти мотивы его шокирующей атаки на мастера-джедаи. Исследовав друга, Файвс находит секретный чип в его голове, как и в своей.
Тело Тапа отправляют на Корусант, где его тело должно быть осмотрено личным врачом канцлера. Файвс также исследует этот вопрос и обнаруживает, что модифицированный код был скрыт в умах всех клонов.
Стремясь найти больше ответов на вопросы об убийстве, Файвс пытается лично поговорить с канцлером Палпатином, но тот обвиняет его в покушение на себя, и даёт гвардии расстрелять единственного, кто знает о чипах.
Раш Кловис связывается с Падме Амидалой с просьбой о помощи. Выступив против коррупции на своей планете, Кловис теперь стал мишенью охотника за головами Эмбо. Вместе с Падме он теперь пытается покинуть свою планету и получить помощь.
Вернувшись на Корусант, Кловис совершает сомнительную сделку, чтобы стать лидером своего клана, который глубоко погряз в коррупции. Энакин не доверяет Кловису, вызывая напряженность в отношениях с Падме.
Кловис «справляется с сепаратистами» и, следовательно, провоцирует войну на Сципио, тем самым провоцируя Республику на вмешательство и, в конечном счете, выиграв битву.
Мирному миру Бардотта угрожает древнее пророчество. С тех пор, как все духовные лидеры исчезли, народ Бардотты попросили сенат помочь. Джа Джа Бинкс и Мейс Винду отправляются на Бардотту.
Чтобы исполнить тёмное пророчество, таинственный культ похищает королеву планеты Бардотта. Теперь мастер-джедай Мейс Винду и представитель Сената Джа Джа Бинкс должны сделать все, чтобы остановить культ — его проповедует призрак Матери Талзин, сестра ночи. Если они потерпят неудачу, культ может развязать ужасную войну. ...
Мастер-джедай Сайфо-Диас несколько лет назад умер при загадочных обстоятельствах. Когда тайная миссия джедаев случайно находит его световой меч, Энакин Скайуокер, Оби-Ван Кеноби и Мастер Йода снова расследуют смерть Сайфо-Диаса. Чтобы они не раскрывали заговор ситхов, Дарт Сидиус приказывает Дуку стереть все следы, связанные с убийством мастера. Это успешно работает, и Дуку ускользает вскоре после того, как Оби-Ван и Энакин узнают, что он был тем, кто убил Диаса под его псевдоним ...
Йода глубоко расстроен, когда он слышит голос своего покойного друга Квай-Гон Джинна в его голове, потому что он знает, что даже джедай не может говорить с живыми. Совет Джедаев обеспокоен поведением Йоды и хочет изучить его дальше. Но с помощью Энакина Йода бежит из больницы, и намеревается найти источник голоса сам. ...
Руководствуясь Силой, Йода отправляется в самое сердце галактики. Там, на планете, где находится место Силы, он должен столкнуться с трудными испытаниями. Только после их прохождения мудрецы посчитают его достойным изучения глубочайших тайн Силы.
На Коррибане, планете Ситхов, пришло время для Йоды пройти свой последний тест. В это время Дарт Сидиус призывает графа Дуку, после чего дуэт планирует сломать Йоду через образ конфронтации между лордами Ситхов и Йодой вместе с Скайуокером. Йода должен выбрать: спасти Скайуокера или победить Сидиуса. ...