Двенадцать колоний, расоложенных на двенадцати планетах ведут тысячелетнюю войну против роботоподобной расы сайлонов, стремящихся истребить человечество. Неожиданно сайлоны передают правительству колоний, пользуясь посредничеством графа Балтара, предложение о перемирии. Только командер звёздного крейсера «Галактика» Адама подозревает, что сайлоны приготовили ловушку, и сообщает о своих подозрениях президенту Адару, но тот не сомневается в словах Балтара. Адама организует специальный патруль, состоящий из лучших пилотов: его сына капитана Аполло и его друга лейтенанта Старбака. Младшему сыну Адама Заку удается уговорить взять его вместе с ними. Патруль обнаруживает, что армада сайлонов ждёт в засаде. Чтобы предупредить флот, вайперам приходится сражаться с сайлонами, и истребитель Зака оказывается уничтожен врагом. Во время атаки сайлонов только «Галактике» удаётся отразить нападения, когда как крейсер «Атланта» с президентом на борту и несколько других кораблей гибнут в бою. «Галактика» возвращается к своей родной планете Каприке и обнаруживает её в руинах. Флот сайлон атаковал все двенадцать колоний. «Галактика» берёт на борт выживших и приказывает всем гражданским судам следовать за ней. Выжившие надеяться найти легендарную тринадцатую колонию, расположенную на планете Земля, координаты которой были давно утеряны. Её местоположение известно только последнему лорду Кобола, планеты-колыбели человечества, которую люди покинули тысячи лет назад, чтобы устремиться к звёздам. В поисках Земли Адаме помагают его старший помощник полковник Тай, командир синего эскадрона Аполло, лейтенант Старбак и лейтенант Бумер. Не смотря на помощь, которую граф Балтар оказал сайлонам, они собираются казнить его. В телевизионной версии он в последний момент избегает казни, помогая сайлонам в поисках человеческого флота, в киноверсии вождь сайлонов приказывает центуриону убить Балтара и тот погибает.
Когда Сайлоны обманули человеческий флот и уничтожили все его корабли кроме одного - звездного крейсера "Галактика", командир Адама подбирает оставшихся в живых людей на 12 мирах колонии и уводит их в поисках легендарной 13-й колонии - Земли. Когда флот решает остано� ...
Аполло и Старбак обнаруживают дыру в пространстве. Командир Адама убежден, что эта дыра приведет их к планете Кобол, и приказывает тщательно проверить ее.
В то время как командир Адама приводит разрозненный флот к планете Кобол, где он надеется найти ключи к расположению Земли, пилотов вайперов скручивает болезнь, не позволяющая женщинам исполнять обязанности по патрулированию. И в этот момент изменник Балтар веде� ...
Аполло высаживается на затерянную пограничную планету, где ему встречается женщина с сыном ... и подбитый сайлон по кличке "Рыжий".
Старбаку поручают протестировать новый ультра-скоростной, но невооруженный Вайпер с говорящим компьютером на борту по имени КОРА; но когда он встречает бутлегера, который крадет Вайпер, Старбака арестовывает Галактическая Полиция тюремной планеты.
Балтар пытается завлечь Галактику в зону поражения гигантской пульсарной пушки, про которую Адама предупрежден заранее.
Аполло и Старбак ведут группу каторжников на самоубийственную миссию по уничтожению пушки, которая размещается на ледяной планете.
Когда цейлонская атака уничтожает большинство кораблей снабжения, Галактика вынуждена обменивать оборудование на пищу на сельскохозяйственной планете, подвергшейся нападению Бореев, группы свино-подобных мародеров.
Старбак разбивается на Триллионе, планете, где сайлонцы уничтожили все население за исключением группы подростков, которые стали воинами, чтобы вызволить своего порабощенного отца.
Находяясь на патрулировании, Аполло и Старбак наталкиваются на считавшийся уже потерянным звездный крейсер Пегас, которым командует живая легенда - коммандор Кейн.
Бравый Командир Кейн настаивает на присоединении Галактики к нему в лобовой атаке на Сайлонов - нападении, которое Адама считает самоубийством.
Нападение сайлонских камикадзе оставляет Галактику гореть в космосе, без возможности погасить пламя, которое захватило в ловушку Бумера, Афину, и Бокси, и только Аполло и Старбаку удалось вырваться в открытый космос.
Пока флот зачумляют мерцающие огоньки, которые летают вдоль и поперек так быстро, что за ними не угнаться, Аполло, Старбак, и Шеба находят остатки крушения, а также таинственного, и кажется всемогущего Графа Илбиса, который помогает им захватить Балтара.
Пока флот зачумляют мерцающие огоньки, которые летают вдоль и поперек так быстро, что за ними не угнаться, Аполло, Старбак, и Шеба находят остатки крушения, а также таинственного, и кажется всемогущего Графа Илбиса, который помогает им захватить Балтара.
Старый главарь по кличке Хамелеон приходит к Старбаку и убеждает его, что он, возможно, является его отцом, рассчитывая что тот поможет ему отвертеться от троицы кровожадных Борелианцев, которые охотятся за ним, чтобы рассчитаться за другого главаря.
Когда соперника Старбака в популярном спортивном соревновании находят убитым, все свидетельства указывают на Старбака; и только Аполло верит в невиновность Старбака.
Аполло и Старбак находят примитивный бездвижный корабль, имеющий на борту мужчину, женщину, и четверо детей, которые заявляют, что они с Терры, подобной Земли планете, находящейся в состоянии войны с злым Восточным Альянсом.
Балтар планирует побег с помощью троицы бореллианцев и Вооруженных Сил Восточного Альянса. Членов Совета Двенадцати захватывают в заложники, и Адама вынужден удовлетворить требования беглецов.
Аполло и Старбак следуют за кораблем беглецов Восточного Альянса до самой Терры, где они помогают терранам избежать ядерного уничтожения, с помощью расы белых светлячков, которые раньше помогли им нанести поражение Графу Илбису.
Старбак возвращается к своей давно потерянной любви, Авроре, которая участвует в попытке освободить пассажирское судно Селестрия от капитана-диктатора.
Вместо того, чтобы продолжать бежать от врагов, команда Галактики начинает широкомасштабное нападение на базу сайлонов.