После глобальной пандемии «красного гриппа», которая убила или заразила более 80% мирового населения, команда изолированного неинфицированного эсминца ВМС США, вымышленного «Нэйтана Джеймса», должна попытаться найти лекарство и остановить вирус, чтобы спасти человечество. Сюжет построен на поисках и создании вакцины и лекарства, в дальнейшем матросам «Нэйтана Джеймса» приходится бороться с врагами, которые воспользовались всемирной эпидемией и паникой в корыстных целях: так, в конце первого и начале второго сезона команда корабля попала в ловушку Эми Грандерсон — высокопоставленной чиновницы, объявившей себя верховной властью США и строящей «новый мир». Когда вирус был уже побеждён, возникла новая угроза — массовое заражение сельскохозяйственных культур т.н. «красной ржавчиной», делающей растения непригодными в пищу и грозившей глобальным голодом. Виновником этого вируса и главным антагонистом четвёртого сезона стал безумный учёный, мечтающий о мировом господстве.
Конфронтация с Олимпией продолжается. Доктор Скотт узнает о "избирательности" города. Угольную электростанцию захватывают. Чендлер находит новых союзников. Куинси спасает первоначальный штамм, заплатив за это собственной жизнью.
Команда постепенно, шаг за шагом, отвоевывает себе обратно корабль. В Балтиморе же идет штурм Олимпии. Ранено несколько важных членов экипажа. Эмми Грандерсон преподносит несколько сюрпризов.
Доктор Нильс Соренсен жив и наконец ступил на землю, скрывая особенности своего здоровья."Натан Джеймс" прибывает в родной Норфолк. Команда ищет своих родных, и кто-то находит их живыми, кто-то - в списках погибших, а кто-то лишь следы. Для всех наступает время выбора - продолжить миссию или же остаться и начать восстанавливать свою жизнь. Команда нашла способ поддержать Алишу Грандерсон. ...
В команде пополнение - старшина Вольф "Волк" Тейлор и лейтенант Равен Бивас. Команда вновь получает миссию - найти плавучий госпиталь "Милосердие" на борту которого - вывезенное из Норфолка лабораторное оборудование. Когда им это удается, он понимают, что на корабле не только врачи, но и новый крупный противник. Доктор Соренсен опять оказывается на не на той стороне. ...
Новый крупный противник - подводная лодка, превосходящая "Натан Джеймс" в военной мощи. Обе стороны пытаются различными способами выяснить цели друг друга. Доктор Соренсен находит информацию, из-за которой случается большая трагедия. Доктор Скотт и командор Чендлер выясняют истинные мотивы Шона и Неда Рамси. ...
Наставник доктора Скотт убит, однако он смог подтвердить, что есть иной способ распространения вакцины. Пока доктор Скотт ищет этот способ, у трех отрядов ВМС США есть задание на суше. Некий культ избранных тесно связан с противником на подлодке. Чендлер узнаёт, что у Шона Рамси есть план по захвату целой страны одним махом, предоставив народу Президента США. ...
Чендлер со своей группой саботируют выступление Президента, дабы командор смог внедриться в охрану Миченера и спасти его от людей Рамси. Грин и Текс в ходе разведки натыкаются на Соренсена. Тем временем доктор Скотт эксперимнентирует с передачей вируса по воздуху, но безуспешно. ...
Миченер отказывается идти на сотрудничество с Чендлером, а по кораблю пошли слухи, что Президента держат взаперти. Командование корабля пытается получить от Миченера информацию по подлодке и убедить его, что Шон Рамси - угроза, но позже он пытается покончить с собой из-за угрызений совести, но его вовремя спасают. ...
Доктор Скотт вынуждена работать с Соренсеном, и для разработки новой вакцины необходимо найти ракушки. Для этих целей отправляют катер с десантом, и во время обыска одного из помещений последние натыкаются на группу подростков, которым предложили провиант за моряков с "Натана Джеймса". В итоге десанту приходится вступить в бой с Избранными, эвакуировав почти всех подростков на корабль. После боя к Чендлеру попадают несколько заложников и их мобильники, через которые, скорее всего ...
На корабле проходит расследование гибели Соренсена. Под подозрение попадает доктор Скотт. Тем временем Чендлер с частью команды пытается разгадать тайны сети, которую построили оккультисты. Риос узнаёт о том, что натворила Рейчел и говорит ей, что у неё осталось очень мало времени на разработку новой вакцины, которая передаётся как вирус. Вскоре после прорыва доктор Скотт приглашают на беседу с Чендлером, где во время разговора на повышенных тонах она признаётся в убийстве. По хо ...
Грин и Текс оказывают помощь выжившим после подрыва флотилии, попутно выясняя, что сигнал "Валькирии" идёт со старой буровой вышки. Чендлер, Слэттери и Миченер решают произвести захват платформы для захвата "Валькирии" и использования её против Рамси. Чендлер и ещё несколько человек занимают вышку и находят создателя "Валькирии". Однако почти одномоментно на группу, помогающую выжившим на берегу и на платформу нападают. Грину и Тексу удаётся сбежать с земли на "Натан Джеймс", а в ...
Командование «Натана Джеймса» планирует атаку на подлодку и с этой целью начинают дезинформацию через сеть «Валькирия», дабы заманить противника в нужное место. Попутно Миченера, доктора Скотт и других лиц, под охраной, которые важны для миссии, отправляют на берег инкогнито. ...
Миченер записывает видеообращение и транслирует его через все возможные каналы связи. В то же время доктор Скотт и Валькирия разъясняют принцип действия вакцины и работу программы «Покойник». Текс оставляет команду и отправляется на поиски своей семьи, но находит лишь могилу жены, а дочь уехала в Мемфис. Тем временем оккультисты планируют атаку в Мемфисе, дабы подорвать и без того хрупкое доверие народа к военным. Текс узнаёт про скорую атаку и предупреждает «Натан Джеймс». В Мем ...