Всё должно быть синхронизировано. Я синхронизировал и смотрел 3-й сезон именно с этими дорожками, которые на FTP.
Есть предположение, в чём может быть дело: примерно с месяц на FTP с 5 по 10 серию лежали другие дорожки (по 43 минуты), потом я всё синхронизировал, и Hattak перезалил заново эти дорожки (по 41 минуте) примерно неделю назад. Попробуйте скачать их заново. Если что не так - пишите, будем разбираться дальше